在基于Hadoop的用户网站浏览分析系统中，Hadoop发挥着核心作用。该系统使用Hadoop分布式文件系统（HDFS）来存储大量的用户网站浏览数据，如访问时间、页面链接和用户活动等。HDFS支持高吞吐量数据访问，使得系统能够有效地存储和管理大规模数据集。此外，利用Hadoop的MapReduce编程模型，系统能并行处理这些大数据，从而分析用户行为，识别模式和趋势。
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